Этот диагностически важный, но не всегда безопасный метод исследования пищевода должен находиться лишь в арсенале специалиста по эндоскопии. Обычно берут кусочек ткани специальными щипцами для исследования с целью исключить или подтвердить опухолевый процесс. После биопсии остаются небольшие кровоточащие ранки, которые довольно быстро заживают. Опасность инфицирования стенок или прободения невелика. Морфологическое исследование биоптата производится в обычном микроскопе, реже методом электронной микроскопии.